Năm 2021, Ngô Hoàng Ngân bị Ủy ban Kiểm tra Trung ương ra quyết định kỷ luật khiển trách giai đoạn 2013–16, khi ông là Bí thư Đảng ủy Than Quảng Ninh, Phó Tổng Giám đốc Vinacomin. Ủy ban Kiểm tra Trung ương điều tra và kết luận rằng Ban Thường vụ Đảng ủy Than Quảng Ninh và Ban Thường vụ Đảng ủy Vinacomin do ông tham gia lãnh đạo giai đoạn này đã vi phạm nguyên tắc, quy chế làm việc, cụ thể là thiếu trách nhiệm, buông lỏng lãnh đạo, chỉ đạo, thiếu kiểm tra, giám sát để nhiều tổ chức đảng, lãnh đạo và cán bộ các đơn vị cấp dưới vi phạm quy định của Đảng, pháp luật của Nhà nước về quản lý, khai thác than tại tỉnh Quảng Ninh trong thời gian dài. Những vi phạm này được kết luận đã "gây hậu quả nghiêm trọng, để tình trạng khai thác than trái phép diễn ra phức tạp, kéo dài, thất thoát tài nguyên khoáng sản, gây khó khăn cho hoạt động quản lý, khai thác tài nguyên, ảnh hưởng xấu đến uy tín của tổ chức Đảng, gây bức xúc trong xã hội".[12]